Laboratorio per il sequenziamento del DNA

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strumentazione per sequenziamento DNA

Responsabile: Prof. Andrea Franzetti

Ubicazione: edificio U1, piano 5, stanza 5067

Per infomrazioni e richieste scrivere a: ngs.disat@unimib.it

Strumentazione

La strumentazione di sequanziamento del DNA comprende un analizzatore di bio-frammenti (Bioptic Inc.), il sistema MiSeq Illumina (Illimina Inc.), l'attrezzatura per l'estrazione del DNA da diversi materiali e la preparazione delle librerie del DNA. Il sistema MiSeq è una piattaforma di sequenziamento DNA che permette la generazione di cluster, l'amplificazione, il sequenziamento e l'analisi dei dati in un unico strumento.
 
Il sistema MiSeq si basa sulla chimica del sequenziamento per sintesi (SBS). 
Le caratteristiche principali del sistema sono:
• Supporta letture fino a 2 × 300 bp (paired end)
• Produce fino a 14 Gb di dati di alta qualità
• Produce fino a 20 milioni di letture per corsa
• Sistema aperto compatibile con preparazioni di librerie di terze parti 
 
Le principali applicazioni nelle scienze della vita e ambientali sono:
- il sequenziamento di genomi completi di ceppi virali/batterici di interesse medico e industriale;
- studi di ecologia, che mirano ad ottenere una completa caratterizzazione della struttura e delle funzioni delle comunità biologiche presenti in un'ampia gamma di ambienti naturali e associati all'ospite;
- il sequenziamento e il profilo di espressione dei geni bersaglio;
- lo studio e la caratterizzazione del DNA ambientale (eDNA) in diversi ambienti naturali e antropizzati.
 
Attività
L'infrastruttura è a disposizione dei gruppi di ricerca di Ateneo e offre servizio conto-terzi a soggetti esterni. Per informazioni ngs.disat@unimib.it